La cripta è situata sotto il presbiterio della chiesa arcipretale di Brentonico. Essa è la testimonianza architettonica artistica e storica della dignità del sito pievano. E' un severo ambiente romanico di pietra ad arcate a volte a crociera rette da una doppia fila di colonne quadrangolari, con capitello a stampella. Una di esse è cilindrica con capitello crociato scolpito a croci e viticci stilizzati.