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Il lago e la relativa area protetta rappresentano una zona umida di notevole interesse vegetazionale, floristico e faunistico, oltre che di elevato pregio paesaggistico e storico. Costituisce infatti una stazione relitta per un importante contingente floristico con rare specie natanti e radicanti. Attorno al lago sono presenti canneti a cannuccia di palude, particolarmente estese nella parte meridionale presso l'immissione del fiume Tresa; in questi ambienti e negli acquitrini vegetano tipiche piante palustri, anche rare in Toscana.