Il CEAMAT intende produrre un'intensa azione di formazione, educazione, osservazione e studio, che traduca i principi dello sviluppo economico particolarmente responsabili delle evoluzioni biologiche negative (surriscaldamento del globo e dei mari, principale fattore di inquinamento delle acque e delle coste) in direzione di una "sostenibilità dello sviluppo". Ovvero, in direzione di uno sviluppo che renda equilibrato il rapporto tra crescita economica e equilibrio dell'ecosistema marino e costiero.
Il CEAMAT si configura come un'organizzazione di mezzi e funzioni molto simile alle strutture classiche dei centri di educazione ambientale, con la variante derivante dall'utilizzo di due strutture: una a terra presso "Casa del Parco" e l'altra su di un battello attrezzato che attraverserà il tratto di mare prospiciente il Parco di Porto Conte, spiegandosi verso la costa che va dal Parco Nazionale dell'Asinara fino alle coste della Gallura, facendo anche scalo nel sud della Corsica.