| | | Alnete del Lago di Varese (IT2010022) | 296 ha |
| | | Ansa di Castelnovate (IT2010013) | 302 ha |
| | | Boschi del Ticino (IT2080301) | 20.553 ha |
| | | Brughiera del Dosso (IT2010012) | 455 ha |
| | | Brughiera del Vigano (IT2010010) | 510 ha |
| | | Canneti del Lago Maggiore (IT2010502) | 227 ha |
| | | Grotte del Campo dei Fiori (IT2010004) | 894 ha |
| | | Lago di Biandronno (IT2010006) | 134 ha |
| | | Lago di Comabbio (IT2010008) | 467 ha |
| | | Lago di Ganna (IT2010001) | 106 ha |
| | | Lago di Varese (IT2010501) | 1.738 ha |
| | | Monte Legnone e Chiusarella (IT2010002) | 751 ha |
| | | Monte Martica (IT2010005) | 1.057 ha |
| | | Monte Sangiano (IT2010018) | 195 ha |
| | | Monti della Valcuvia (IT2010019) | 1.629 ha |
| | | Palude Bozza - Monvallina (IT2010017) | 21 ha |
| | | Palude Brabbia (IT2010007) | 460 ha |
| | | Palude Bruschera (IT2010015) | 164 ha |
| | | Paludi di Arsago (IT2010011) | 543 ha |
| | | Parco Regionale Campo dei Fiori (IT2010401) | 1.298 ha |
| | | Pineta pedemontana di Appiano Gentile (IT2020007) | 220 ha |
| | | Sabbie d'Oro (IT2010021) | 22 ha |
| | | Sorgenti del Rio Capricciosa (IT2010009) | 76 ha |
| | | Torbiera di Cavagnano (IT2010020) | 6 ha |
| | | Turbigaccio, Boschi di Castelletto e Lanca di Bernate (IT2010014) | 2.481 ha |
| | | Val Veddasca (IT2010016) | 4.919 ha |
| | | Versante Nord del Campo dei Fiori (IT2010003) | 1.312 ha |
