Le site, constitué par une brève section de Doire Baltée et de sa plaine alluviale, héberge l'habitat prioritaire de "Forêts alluviales à Alnion glutinoso-incanae", unique formation de ce genre présente dans la portion de la vallée comprise entre Courmayeur et Aoste.
La zone se distingue par sa fonction de zone de halte pour les oiseaux migrateurs liés aux milieux humides ; malgré sa valeur nettement inférieure par rapport à la zone humide de Les Îles de Saint-Marcel, le Marais représente un point de refuge pour les oiseaux aquatiques dans une région à l'intérieur du massif alpin.
Il en effet est utilisé par les migrateurs qui, pour une raison ou pour une autre, ont abandonné les routes principales et doivent passer les Alpes justement dans la zone où elles sont les plus hautes. On y a la nidification du colvert, de la poule d'eau et de la rousserolle verderolle ; parmi les espèces de migrateurs, on signale le héron pourpré, le héron cendré, le butor étoilé.
La végétation est typique des milieux riches en eau, caractérisés par la forêt hygrophile de la rive et par la roselière. Dans la forêt dominent l'Aulne blanc, le Saule blanc et le Peuplier noir et, dans le sous-bois humide, le Cornouiller sanguin (Cornus sanguinea) et la Reine-des-prés (Filipendula ulmaria). Le secteur oriental est constitué de roselière avec dominance de Roseau commun (Phragmites australis) associée à l'Alpiste roseau (Typhoides arundinacea), la Massette à larges feuilles (Typha latifolia) et à la Laîche paniculée (Carex paniculata).
La Réserve représente une zone de halte intra-alpine pour les oiseaux. Parmi les migrateurs nicheurs on signale le Col-vert, la Poule d'eau, la Bergeronnette grise, le Coucou gris, la Rousserolle verderolle et la Fauvette à tête noire. Au printemps et en automne on peut observer des oiseaux occasionnels comme le Grèbe castagneux, le Grèbe huppé, le Héron cendré, le Fuligule morillon, le Bruant des roseaux, la Huppe fasciée le Petit gravelot, la Mouette rieuse et bien d'autres.