Il parco si trova nel bacino idrografico del fiume Brda. Una delle ragioni principali per la sua creazione è stata la volontà di proteggere i bacini d'acqua: il territorio del parco comprende infatti 21 laghi (18 dei quali hanno una superficie superiore all'ettaro) caratterizzati dall'estrema purezza delle loro acque, poiché nei dintorni non ci sono industrie né fattorie. La pulizia di queste acque è testimoniata dalla presenza della lobelia acquatica (Lobelia Dortmanna, chiamata in polacco "stroiczka jeziorna"), una pianta molto sensibile all'inquinamento e che cresce solo in acque pulitissime.
La foresta vergine della Pomerania, che si estende sui territori di Chojnice, Koscierzyna, Tuchola e Starogard, rappresenta uno dei più vasti sistemi forestali polacchi, con una superficie di oltre 120.000 ettari corrispondenti all'1,5% del territorio nazionale. Le foreste di Tucholskie, che fanno parte di questo sistema, risalgono a 12.500 anni fa e si trovano in uno stato ancora relativamente intatto, benché parte di esse abbiano ricevuto lo status di parco nazionale solo di recente.