La ZPS Alpi Carniche riveste un ruolo particolarmente importante nell'ambito della rete Natura 2000 del Friuli Venezia Giulia per la sua elevata estensione e quindi per l'elevato numero di habitat e specie endalpici e mesalpici in essa molto ben rappresentati. Presenta sia ecosistemi legati a substrati calcarei sia silicei e questo dato determina l'elevata biodiversità floristica oltre che la presenza di specie rare o al limite d'areale.
Per quanto riguarda la fauna il sito ospita una popolazione di Pernice bianca (Lagopus mutus) di circa 20/30 coppie di assoluto rilievo nel contesto della rete a livello regionale; il sito inoltre costituisce inoltre una core area per il Gallo forcello (Tetrao tetrix) e contiente situazioni ambientali idonee a specie di areale vasto come l'Aquila reale (Aquila chrysaetos), l'Orso bruno (Ursus arctos), la Lince europea (Lynx lynx) rivestendo per tali entità un ruolo significativo nella rete regionale. Analogamente questo sito fornisce un contributo rilevante per quanto concerne alcune entità prettamente forestali come Civetta nana (Glaucidium passerinum), Civetta capogrosso (Aegolius funereus), Picchio cenerino (Picus canus), Picchio tridattilo (Pycoides tridactylus).