L'area protetta è di particolare pregio naturalistico e storico-culturale. Il patrimonio boschivo è composto da querceti misti, castagneti e da una faggeta di antico impianto.
Il paesaggio è interrotto da piccoli rii, laghetti e numerose radure, oltre che da giardini monumentali realizzati intorno alle ville storiche. Grazie alla varietà di ambienti, anche la fauna è molto ricca: fra i mammiferi è facile osservare il Capriolo, animale simbolo del Parco, lo Scoiattolo e, nei prati, la Lepre. Nei laghi del Parco si trova la rara Testuggine d'acqua, schiva e difficile da osservare.
Più che in altri luoghi, il paesaggio che si ammira nel Parco Boschi di Carrega è il risultato dell'interazione fra la natura e l'intervento dell'uomo che, nei secoli, ha modificato il territorio con interventi di gestione agroforestale e con importanti opere di regimazione idraulica.