Fu costruito dalla liberalità del Papa Pio VI, per l'educazione ed istruzione della gioventù maschile, come attesta l'epigrafe latina dell'atrio. Autore del progetto definitivo fu l'architetto Carlo Colombi di Merate. L'esterno del palazzo è di stile neoclassico con il solenne portale di ingresso in pietra locale del Monte Affilano, portale sovrastato da una finestra sulla quale campeggia lo stemma, che reca incise le parole latine Seminarium Nazionale, dichiarato tale da Napoleone Bonaparte durante l'occupazione di Subiaco delle truppe francesi.