| | Abbazia di Monteveglio (IT4050016) | 881 ha |
| | Alto Senio (IT4070017) | 1.015 ha |
| | Bacini ex-zuccherificio di Argelato e Golena del Fiume Reno (IT4050026) | 314 ha |
| | Biotopi e ripristini ambientali di Bentivoglio, San Pietro in Casale, Malalbergo e Baricella (IT4050024) | 3.205 ha |
| | Biotopi e Ripristini ambientali di Budrio e Minerbio (IT4050023) | 875 ha |
| | Biotopi e Ripristini ambientali di Crevalcore (IT4050025) | 699 ha |
| | Biotopi e Ripristini ambientali di Medicina e Molinella (IT4050022) | 4.022 ha |
| | Boschi di San Luca e Destra Reno (IT4050029) | 1.951 ha |
| | Bosco della Frattona (IT4050004) | 392 ha |
| | Bosco di Sant'Agostino o Panfilia (IT4060009) | 188 ha |
| | Cassa di espansione del Torrente Samoggia (IT4050031) | 148 ha |
| | Cassa di espansione Dosolo (IT4050030) | 62 ha |
| | Contrafforte Pliocenico (IT4050012) | 2.628 ha |
| | Corno alle Scale (IT4050002) | 4.579 ha |
| | Gessi Bolognesi, Calanchi dell'Abbadessa (IT4050001) | 4.296 ha |
| | Gessi di Monte Rocca, Monte Capra e Tizzano (IT4050027) | 226 ha |
| | Golena San Vitale e Golena del Lippo (IT4050018) | 69 ha |
| | Grotte e Sorgenti pietrificanti di Labante (IT4050028) | 5 ha |
| | La Bora (IT4050019) | 40 ha |
| | La Martina, Monte Gurlano (IT4050015) | 1.107 ha |
| | Laghi di Suviana e Brasimone (IT4050020) | 1.902 ha |
| | Manzolino (IT4040009) | 326 ha |
| | Media Valle del Sillaro (IT4050011) | 1.108 ha |
| | Monte dei Cucchi, Pian di Balestra (IT4050032) | 2.450 ha |
| | Monte Radicchio, Rupe di Calvenzano (IT4050014) | 1.382 ha |
| | Monte Sole (IT4050003) | 6.476 ha |
| | Monte Vigese (IT4050013) | 2.628 ha |
| | Po di Primaro e Bacini di Traghetto (IT4060017) | 1.436 ha |
| | Valli di Argenta (IT4060001) | 2.905 ha |
| | Vena del Gesso Romagnola (IT4070011) | 5.540 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Bisana | 64 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Collettore delle Acque Alte | 28 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Dosolo | 5 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Ex risaia di Bentivoglio | 34 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Golena San Vitale | 43 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico La Bora | 21 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Torrente Idice | 39 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Vasche ex zuccherificio di Crevalcore | 65 ha |
| | Paesaggio Protetto Colline di San Luca | 4.996 ha |
| | Valle Campotto e Bassarone | n/a |
| | Valle Santa | n/a |