| | Adriatico settentrionale - Emilia-Romagna (IT4060018) | 31.160 ha |
| | Alta Valle del Torrente Sintria (IT4070016) | 1.174 ha |
| | Alto Senio (IT4070017) | 1.015 ha |
| | Bacini di Conselice (IT4070019) | 21 ha |
| | Bacini di Massa Lombarda (IT4070023) | 42 ha |
| | Bacini di Russi e Fiume Lamone (IT4070022) | 132 ha |
| | Bacini ex-zuccherificio di Mezzano (IT4070020) | 39 ha |
| | Bacino della ex-fornace di Cotignola e Fiume Senio (IT4070027) | 20 ha |
| | Bardello (IT4070002) | 99 ha |
| | Biotopi di Alfonsine e Fiume Reno (IT4070021) | 472 ha |
| | Calanchi pliocenici dell'Appennino faentino (IT4070025) | 1.098 ha |
| | Ortazzo, Ortazzino, Foce del Torrente Bevano (IT4070009) | 1.256 ha |
| | Pialassa dei Piomboni, Pineta di Punta Marina (IT4070006) | 456 ha |
| | Pialasse Baiona, Risega e Pontazzo (IT4070004) | 1.596 ha |
| | Pietramora, Ceparano, Rio Cozzi (IT4080007) | 1.955 ha |
| | Pineta di Casalborsetti, Pineta Staggioni, Duna di Porto Corsini (IT4070005) | 579 ha |
| | Pineta di Cervia (IT4070008) | 194 ha |
| | Pineta di Classe (IT4070010) | 1.082 ha |
| | Pineta di San Vitale, Bassa del Pirottolo (IT4070003) | 1.222 ha |
| | Podere Pantaleone (IT4070024) | 9 ha |
| | Punte Alberete, Valle Mandriole (IT4070001) | 972 ha |
| | Relitto della piattaforma Paguro (IT4070026) | 66 ha |
| | Salina di Cervia (IT4070007) | 1.095 ha |
| | Valli di Argenta (IT4060001) | 2.905 ha |
| | Valli di Comacchio (IT4060002) | 16.781 ha |
| | Vena del Gesso Romagnola (IT4070011) | 5.540 ha |
| | Vene di Bellocchio, Sacca di Bellocchio, Foce del Fiume Reno, Pineta di Bellocchio (IT4060003) | 2.242 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Bacini di Conselice | 9 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Canale dei Mulini di Lugo e Fusignano | 79 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Cotignola | 21 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Podere Pantaleone | 7 ha |
| | Area di riequilibrio ecologico Villa Romana di Russi | 16 ha |
| | Ortazzo e Ortazzino | n/a |
| | Paesaggio Protetto della Centuriazione | 872 ha |
| | Pialassa della Baiona e Risega | n/a |
| | Punta Alberete | n/a |
| | Valle Campotto e Bassarone | n/a |
| | Valle Santa | n/a |
| | Valli residue di Comacchio | 13.500 ha |