| | | Arcipelago delle Pelagie - area marina e terrestre (ITA040013) | 86 ha |
| | | Bosco di S. Adriano (ITA020025) | 6.821 ha |
| | | Complesso Monte Telegrafo e Rocca Ficuzza (ITA040006) | 5.289 ha |
| | | Foce del Fiume Verdura (ITA040004) | 887 ha |
| | | Foce del Magazzolo, Foce del Platani, Capo Bianco, Torre Salsa (ITA040003) | 1.236 ha |
| | | Fondali delle Isole Pelagie (ITA040014) | 100 ha |
| | | Fondali di Capo San Marco - Sciacca (ITA040012) | 100 ha |
| | | Fondali di Torre Salsa (ITA040016) | 12.730 ha |
| | | Isola di Lampedusa e Lampione (ITA040002) | 7 ha |
| | | Isola di Linosa (ITA040001) | 8 ha |
| | | La Montagnola e Acqua Fitusa (ITA040011) | 311 ha |
| | | Litorale di Palma di Montechiaro (ITA040010) | 1 ha |
| | | Maccalube di Aragona (ITA040008) | 436 ha |
| | | Monte Cammarata - Contrada Salaci (ITA040005) | 2.107 ha |
| | | Monte d'Indisi, Montagna dei Cavalli, Pizzo Pontorno e Pian del Leone (ITA020031) | 2.432 ha |
| | | Monte Genuardo e Santa Maria del Bosco (ITA020035) | 2.683 ha |
| | | Monte Rose e Monte Pernice (ITA020029) | 2.529 ha |
| | | Monte San Calogero (Sciacca) (ITA040009) | 127 ha |
| | | Monti Sicani, Rocca Busambra e Bosco della Ficuzza (ITA020048) | 59.355 ha |
| | | Pizzo della Rondine, Bosco di S. Stefano Quisquina (ITA040007) | 3.160 ha |
| | | Pizzo Muculufa (ITA050010) | 969 ha |
| | | Rocche di Castronuovo, Pizzo Lupo, Gurghi di S. Andrea (ITA020011) | 1.795 ha |
| | | Scala dei Turchi (ITA040015) | 30 ha |
| | | Serra del Leone e Monte Stagnataro (ITA020028) | 3.750 ha |
| | | Sistema dunale Capo Granitola, Porto Palo e Foce del Belice (ITA010011) | 538 ha |
