La Casa religiosa dei Carmelitani scalzi viene fondata nel 1889 quale punto di appoggio nel cammino tra i conventi genovesi ed il Deserto di Varazze.
Nel 1900 all'interno della chiesetta del Convento venne collocato un quadro raffigurante Gesù Bambino di Praga, successivamente sostituito da una statua dello stesso Gesù Bambino solennemente incoronata, nel 1924, con una corona benedetta da Papa Pio XI. Il crescente afflusso di pellegrini portò ad un ampliamento del santuario, consacrato "basilica minore" nel 1928.