| | Baia Settefrati e spiaggia di Salinelle (ITA020051) | 68 ha |
| | Boschi di Gibilmanna e Cefalù (ITA020002) | 2.570 ha |
| | Boschi di Granza (ITA020032) | 1.878 ha |
| | Boschi di San Mauro Castelverde (ITA020003) | 3.559 ha |
| | Boschi Ficuzza e Cappelliere, Vallone Cerasa, Castagneti Mezzojuso (ITA020007) | 4.627 ha |
| | Bosco di S. Adriano (ITA020025) | 6.821 ha |
| | Bosco di Sperlinga, Alto Salso (ITA060009) | 1.781 ha |
| | Cala Rossa e Capo Rama (ITA020009) | 15 ha |
| | Calanchi, lembi boschivi e praterie di Riena (ITA020022) | 754 ha |
| | Capo Gallo (ITA020006) | 2 ha |
| | Complesso Calanchivo di Castellana Sicula (ITA020015) | 182 ha |
| | Complesso Pizzo Dipilo e Querceti su calcare (ITA020017) | 4.387 ha |
| | Foce del Fiume Pollina e Monte Tardara (ITA020018) | 2.095 ha |
| | Foce del Torrente Calatubo e dune (ITA010018) | 108 ha |
| | Fondali dell'isola di Ustica (ITA020046) | 100 ha |
| | Fondali di Capo Zafferano (ITA020052) | 2.514 ha |
| | Fondali di Isola delle Femmine - Capo Gallo (ITA020047) | 100 ha |
| | Isola delle Femmine (ITA020005) | 8 ha |
| | Isola di Ustica (ITA020010) | 5 ha |
| | Lago di Piana degli Albanesi (ITA020013) | 637 ha |
| | Montagna Longa, Pizzo Montanello (ITA020021) | 4.923 ha |
| | Monte Cane, Pizzo Selva a Mare, Monte Trigna (ITA020039) | 4.944 ha |
| | Monte Carcaci, Pizzo Colobria e ambienti umidi (ITA020034) | 1.869 ha |
| | Monte d'Indisi, Montagna dei Cavalli, Pizzo Pontorno e Pian del Leone (ITA020031) | 2.432 ha |
| | Monte Genuardo e Santa Maria del Bosco (ITA020035) | 2.683 ha |
| | Monte Grifone (ITA020044) | 1.705 ha |
| | Monte Iato, Kumeta, Maganoce e Pizzo Parrino (ITA020027) | 3.034 ha |
| | Monte Matassaro, Monte Gradara e Monte Signora (ITA020030) | 3.989 ha |
| | Monte Pecoraro e Pizzo Cirina (ITA020049) | 8.603 ha |
| | Monte Pellegrino (ITA020014) | 1 ha |
| | Monte Pizzuta, Costa del Carpineto, Moarda (ITA020026) | 1.949 ha |
| | Monte Quacella, Monte dei Cervi, Pizzo Carbonara, Monte Ferro, Pizzo Otiero (ITA020016) | 8.355 ha |
| | Monte Rosamarina e Cozzo Famò (ITA020043) | 236 ha |
| | Monte Rose e Monte Pernice (ITA020029) | 2.529 ha |
| | Monte S. Salvatore, Monte Catarineci, Vallone Mandarini, ambienti umidi (ITA020004) | 5.815 ha |
| | Monte San Calogero (Gangi) (ITA020041) | 174 ha |
| | Monte San Calogero (Termini Imerese) (ITA020033) | 2.799 ha |
| | Monte Triona e Monte Colomba (ITA020036) | 3.313 ha |
| | Monte Zimmara (Gangi) (ITA020040) | 1.783 ha |
| | Monti Barracù, Cardelia, Pizzo Cangialosi e Gole del Torrente Corleone (ITA020037) | 5.351 ha |
| | Monti Sicani, Rocca Busambra e Bosco della Ficuzza (ITA020048) | 59.355 ha |
| | Parco delle Madonie (ITA020050) | 40.860 ha |
| | Querceti sempreverdi di Geraci Siculo e Castelbuono (ITA020020) | 3.380 ha |
| | Raffo Rosso, Monte Cuccio e Vallone Sagana (ITA020023) | 1 ha |
| | Rocca Busambra e Rocche di Rao (ITA020008) | 6.243 ha |
| | Rocca di Cefalù (ITA020001) | 36 ha |
| | Rocca di Sciara (ITA020045) | 400 ha |
| | Rocche di Castronuovo, Pizzo Lupo, Gurghi di S. Andrea (ITA020011) | 1.795 ha |
| | Rocche di Ciminna (ITA020024) | 1.139 ha |
| | Rocche di Entella (ITA020042) | 178 ha |
| | Rupe di Marianopoli (ITA050009) | 1.161 ha |
| | Rupi di Catalfano e Capo Zafferano (ITA020019) | 2 ha |
| | Serra del Leone e Monte Stagnataro (ITA020028) | 3.750 ha |
| | Sugherete di Contrada Serradaino (ITA020038) | 341 ha |
| | Torrente Vaccarizzo (tratto terminale) (ITA050002) | 440 ha |
| | Valle del Fiume Oreto (ITA020012) | 158 ha |