| | Alto corso del Fiume Fiora (IT51A0019) | 7.111 ha |
| | Basso Merse (IT5190007) | 4.229 ha |
| | Boschi delle Colline di Capalbio (IT51A0029) | 6.024 ha |
| | Campi di alterazione geotermica di M.Rotondo e Sasso Pisano (IT5170102) | 121 ha |
| | Cono vulcanico del Monte Amiata (IT51A0017) | 6.114 ha |
| | Cornate e Fosini (IT51A0001) | 1.403 ha |
| | Duna del Lago di Burano (IT51A0032) | 98 ha |
| | Duna di Feniglia (IT51A0028) | 458 ha |
| | Dune costiere del Parco dell'Uccellina (IT51A0015) | 158 ha |
| | Foreste del Siele e del Pigelleto di Piancastagnaio (IT5190013) | 1.313 ha |
| | Formiche di Grosseto (IT51A0022) | 10 ha |
| | Isola del Giglio (IT51A0023) | 2.094 ha |
| | Isola di Giannutri - area terrestre e marina (IT51A0024) | 11.022 ha |
| | Isolotti grossetani dell'Arcipelago Toscano (IT51A0035) | 11 ha |
| | Lago Acquato, Lago San Floriano (IT51A0030) | 208 ha |
| | Lago dell'Accesa (IT51A0005) | 1.168 ha |
| | Lago di Burano (IT51A0031) | 236 ha |
| | Lago di Burano (IT51A0033) | 489 ha |
| | Laguna di Orbetello (IT51A0026) | 3.694 ha |
| | Medio corso del Fiume Albegna (IT51A0021) | 1.991 ha |
| | Monte Argentario, Isolotto di Porto Ercole e Argentarola (IT51A0025) | 5.723 ha |
| | Monte d'Alma (IT51A0008) | 5.834 ha |
| | Monte Labbro e alta valle dell'Albegna (IT51A0018) | 6.299 ha |
| | Monte Leoni (IT51A0009) | 5.113 ha |
| | Monte Penna, Bosco della Fonte e Monte Civitella (IT51A0020) | 1.488 ha |
| | Monti dell'Uccellina (IT51A0016) | 4.441 ha |
| | Padule della Trappola, Bocca d'Ombrone (IT51A0013) | 489 ha |
| | Padule della Trappola, Bocca d'Ombrone (IT51A0039) | 1 ha |
| | Padule di Diaccia Botrona (IT51A0011) | 1.348 ha |
| | Padule di Scarlino (IT51A0006) | 149 ha |
| | Pianure del Parco della Maremma (IT51A0036) | 3.303 ha |
| | Pineta Granducale dell'Uccellina (IT51A0014) | 626 ha |
| | Poggi di Prata (IT51A0002) | 1.061 ha |
| | Poggio di Moscona (IT51A0010) | 648 ha |
| | Poggio Tre Cancelli (IT51A0004) | 319 ha |
| | Punta Ala e Isolotto dello Sparviero (IT51A0007) | 337 ha |
| | Scoglio dell'Argentarola (IT51A0038) | 100 ha |
| | Tombolo da Castiglion della Pescaia a Marina di Grosseto (IT51A0012) | 373 ha |
| | Val di Farma (IT51A0003) | 8.695 ha |