| | Bonifica della Gherardesca (IT5120105) | 57 ha |
| | Dune litoranee di Torre del Lago (IT5170001) | 123 ha |
| | Ex alveo del Lago di Bientina (IT5120101) | 1.056 ha |
| | Lago di Porta (IT5110022) | 156 ha |
| | Lago di Sibolla (IT5120018) | 74 ha |
| | Lago e Padule di Massacciuccoli (IT5120017) | 1.906 ha |
| | Macchia lucchese (IT5120016) | 406 ha |
| | Monte Castellino - Le Forbici (IT5120002) | 662 ha |
| | Monte Corchia - Le Panie (IT5120014) | 3.964 ha |
| | Monte Croce - Monte Matanna (IT5120012) | 1.249 ha |
| | Monte La Nuda - Monte Tondo (IT5110005) | 523 ha |
| | Monte Pisano (IT5120019) | 8.233 ha |
| | Monte Prato Fiorito - Monte Coronato - Valle dello Scesta (IT5120006) | 1.907 ha |
| | Monte Romecchio - Monte Rondinaio - Poggione (IT5120005) | 715 ha |
| | Monte Sillano - Passo Romecchio (IT5120001) | 257 ha |
| | Monte Sumbra (IT5120009) | 1.865 ha |
| | Monte Tambura - Monte Sella (IT5120013) | 2.013 ha |
| | Orrido di Botri (IT5120007) | 244 ha |
| | Padule di Verciano, Prati alle Fontane e Padule delle Monache (IT5120020) | 397 ha |
| | Pania di Corfino (IT5120004) | 134 ha |
| | Parco dell'Orecchiella - Pania di Corfino - Lamarossa (IT5120003) | 2.008 ha |
| | Praterie primarie e secondarie delle Apuane (IT5120015) | 17.320 ha |
| | Valle del Giardino (IT5120011) | 784 ha |
| | Valle del Serra - Monte Altissimo (IT5120010) | 1.850 ha |
| | Valli glaciali di Orto di Donna e Solco d'Equi (IT5120008) | 2.832 ha |
| | Zone calcaree della Val di Lima e del Balzo Nero (IT5120102) | 1.683 ha |